انتخاب مناسب ترین ژن های رفرنس جهت مطالعات real-time pcr در مراحل ابتدایی زیست تاسماهی ایرانی، acipenser persicus

نویسندگان

آرش اکبرزاده

arash akbarzadeh حمید فرحمند

hamid farahmand فروزنده محجوبی

frouzandeh mahjoubi محمد علی نعمت اللهی

mohammad ali nematollahi کمال الدین حق بین

چکیده

در مطالعاتی که از تکنیک pcr real-time کمی استفاده می شود، به منظور کمی سازی داده های حاصل از اندازه گیری سطوح mrna می بایست میزان mrna ژن هدف را نسبت به میزان mrna یک ژن رفرنس داخلی نرمال سازی کرد. از آنجا که سطح بیان ژن کنترل داخلی می بایست در بین بافت های مختلف و نیز تمامی مراحل رشد یک موجود زنده ثابت بوده و نیز تحت تأثیر تیمارهای آزمایش قرار نگیرد، در هر یک از آزمایش های بیان ژن می بایست ثبات و پایداری بیان چندین ژن رفرنس مورد آزمایش و ارزیابی قرار گیرد تا مناسب ترین ژن رفرنس به منظور نرمال سازی داده های حاصل از بیان ژن هدف انتخاب گردد. در مطالعه حاضر ثبات بیان شش ژن رفرنس شامل actin- beta (actb)، glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (gapdh)، ribosomal protein l6 (rpl6)، ubiquitin (ubq)، ribosomal protein l13 (rpl13) و elongation factor 1-alpha (ef1a) در طی مراحل ابتدایی رشد و تکامل تاسماهی ایرانی با استفاده از تکنیکreal-time pcr taqman مورد ارزیابی قرار گرفت. برآیند کلی نتایج حاصل از نرم افزارهای genorm، bestkeeper و normfinder نشان داد که دو ژن rpl6 و actb از بیشترین ثبات بیان ژن برخوردار بودند، در حالیکه ژن rpl13 بیشترین تغییرات بیان ژن را از خود نشان داد. بر این اساس استفاده از ژن های rpl6، actb و نیز میانگین هندسی آنها به منظور نرمال سازی داده های بیان ژن هدف در مراحل ابتدایی رشد و تکامل تاسماهی ایرانی و نیز سایر گونه های تاسماهیان توصیه می شود.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

توالی یابی و بررسی بیان ژن sox9 طی مراحل تکوینی تاسماهی ایرانی acipenser persicus

ژنsox9 یکی از ژن های کد کننده ی پروتئین بوده که نقش مهمی در تنظیم برخی از فعالیت های سلولی از جمله تکوین گناد جنس نر و غضروف سازی در بین انواع مهره داران ایفا می کند. تاسماهی ایرانی (acipenser persicus) یکی از گونه های مهم تاسماهیان بوده که بومی سواحل جنوبی دریای خزر می باشد. این گونه به دلیل ارزش اقتصادی آن و همچنین بلوغ زودرس نسبت به دیگر گونه های پرورشی از جمله فیل ماهی، از گونه های مورد نظر...

فراوانی و انتخاب غذای زنده توسط بچه تاسماهی ایرانی (Acipenser persicus) در استخرهای خاکی کارگاه مرجانی

تحقیق حاضر به شناسایی و بررسی فراوانی انواع غذای زنده در استخرهای خاکی بچه تاس ماهیان ایرانی و محتویات معده 240 قطعه از آن‌ها پرداخت. چگونگی انتخاب غذای بچه ماهیان با توجه به شاخص انتخاب غذا برای هر ارگانیسم غذایی در شش زمان نمونه‏برداری در استخرهای خاکی مورد مطالعه قرار گرفت. بدین منظور از زئوپلانکتون و بنتوز استخرها و محتویات معده بچه تاس ماهیان ایرانی نمونه‏برداری شد. محدوده شاخص انتخاب غذا...

متن کامل

سطوح باقیمانده هورمون‌ها در تخمک تاسماهی ایرانی (Acipenser persicus) و تاسماهی سیبری (Acipenser baerii) پرورشی

این تحقیق با هدف تعیین باقیمانده سطوح هورمون­های جنسی 17 بتا - استرادیول (E2)، 17 آلفا - هیدروکسی پرو‍ژسترون (17α- OHP)، تستوسترون (T)، و GTH I و GTH II در عصاره تخمک گونه­های تاسماهی ایرانی و تاسماهی سیبری در مؤسسه تحقیقات بین­المللی تاسماهیان دریای خزر مورد مطالعه قرار گرفت. بدین­منظور، مقدار 10 گرم از خاویار هر گونه بطور مجزا هموژنایزه شده، و عصاره آن پس از سانتریفیوژ با دور 3000 به مدت 10 د...

متن کامل

مطالعه ایریدو ویروس (Iridovirus) در مولدین تاسماهی ایرانی (Acipenser persicus) با استفاده از روش PCR

ایریدوویروس‌ها با دارا بودن پنج جنس ایریدوویروس، کلریریدوویروس، راناویروس، لمفوسیستی ویروس و مگالوسیتی ویروس در تعداد زیادی ازگونه‌های ماهیان آب شیرین و شور ایجاد بیماری می‌نمایند. نظر به اینکه ماهیان خاویاری از گونه‌های تجاری و بسیار ارزشمند دریای خزر محسوب شده و ایریدوویروس تاکنون در گونه‌های مختلفی از ماهیان خاویاری نظیر تاسماهی سفید، تاسماهی پاروپوزه، تاسماهی روسی و تاسماهی پاروبینی سفید ...

متن کامل

رشد و نمو بافت غضروف در تاسماهی ایرانی (Acipenser persicus)

  مطالعه حاضر جهت رشد و نمو تکاملی بافت غضروف در تاسماهی ایرانی انجام پذیرفت. برای این منظور70قطعه تاسماهی ایرانی ( Acipenser persicus ) در سال 1389 شامل مراحل قبل از جذب کیسه زرده( 2 و 6روزه)،مرحلهبعد از جذب کیسه زرده(9 روزه)،قبل از رهاسازی (40روزه)، زمان رهاسازی (70روزه)، یکساله و چهار ساله از کارگاه تکثیر و پرورش ماهیان خاویاری شهید بهشتی و شهید عباسپور رشت تهیه گردید. برای این منظوردر مراحل...

متن کامل

تکامل مراحل لاروی تاسماهی ایرانی (Acipenser persicus) با تاکید بر تعیین زمان تغذیه فعال

این مطالعه‌ به تعیین مراحل تکامل لاروی تاسماهی ایرانی (Acipenser persicus) که یکی از مهم‌ترین گونه‌های بومی سواحل جنوبی دریای خزر می‌باشد و زمان شروع تغذیه این ماهی پرداخته است. در این بررسی نمونه برداری لاروها بصورت روزانه‌ از زمان تفریخ تا روز بیست و ششم انجام شد. نمونه‌ها در فرمالین تثبیت و اندازه‌گیری‌های مربوطه همچون طول کل، طول کیسه زرده، طول باله‌ها و سبیلک‌ها، طول سر، قطر چشم، طول پوزه ...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
بوم شناسی آبزیان

جلد ۲، شماره ۳، صفحات ۱۳-۱

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023